Kong et Godzilla se battent contre une menace inconnue et énorme qui se cache dans notre monde - et qui remet en question toute leur existence. «Godzilla e Kong - Il Nuovo Impero» en révèle davantage sur le combat mythique qui a contribué à l'émergence de ces créatures extraordinaires et les a rendues à jamais indissociables de l'humanité.

Au 18e siècle, le roi Frederik V demande que la lande sauvage du Jutland soit colonisée afin d'augmenter les recettes fiscales. Ludvig van Kahlen, un soldat danois émérite, prévoit de s'installer, mais le propriétaire terrien Frederik de Schinkel tente de l'en empêcher. Avec une détermination sans faille, van Kahlen brave tous les obstacles et affronte de Schinkel.

Po doit trouver et former un nouveau guerrier dragon avant de pouvoir prendre ses nouvelles fonctions de chef spirituel. Pour couronner le tout, une puissante magicienne a fait son apparition : Le caméléon peut se transformer en un clin d'œil en n'importe quelle créature. Po a donc besoin d'aide. Il la trouve en la personne de Zhen, une voleuse rusée dont les compétences s'avèrent extrêmement précieuses.